Da ich ihn selber dauernd vergesse:

Der Pfad um Programme in Cydia automatisch zu installieren, also ohne W-LAN/Wi-Fi lautet:

/var/root/Media/Cydia/AutoInstall/

Die Order Cydia und AutoInstall sind nicht von Haus aus vorhanden, und müssen manuell erstellt werden. Einfach eine *.deb Datei in den AutoInstall Ordner packen, und das iPhone neustarten, das Programm/Theme etc wird dann automatisch installiert und danach gelöscht!